2025年1月4日,,南極熊獲悉,,普利茅斯大學(xué)胚胎表型組研究團隊歷經(jīng)十年研發(fā),,推出了一款名為LabEmbryoCam的自主機器人顯微鏡,。該開源實驗室儀器利用3D打印組件,,可自動監(jiān)測和評估水生生物胚胎對環(huán)境變化的反應(yīng),,為水生生物研究提供了前所未有的工具,。
Plymouth1.jpg (126.39 KB, 下載次數(shù): 29)
下載附件
2025-1-4 01:07 上傳
表型組學(xué)研究的新利器
根據(jù)該團隊發(fā)表的研究報告,“在個體范圍內(nèi)獲取高維數(shù)據(jù)”被稱為表型組學(xué),,已應(yīng)用于人類健康相關(guān)的生物學(xué)研究,,如作物科學(xué)和醫(yī)學(xué)。水生生物胚胎由于其體積小,、生態(tài)相關(guān)性強,、分類多樣性高以及功能、空間和時間變化程度高等特點,,成為該研究領(lǐng)域的天然模型,。研究環(huán)境條件如何影響生命早期階段比以往任何時候都更加重要,這也是該團隊將LabEmbryoCam創(chuàng)建為開源項目的原因,。
LabEmbryoCam能夠通過追蹤胚胎發(fā)育來自動監(jiān)測水生生物胚胎發(fā)育的早期階段,。科學(xué)家可以使用這套多功能系統(tǒng)來測量發(fā)育中動物的關(guān)鍵特征,如心跳,、發(fā)育速度和生長速度,,并可同時對大量胚胎的生物過程進行可視化和測量。
Plymouth2.jpg (77.29 KB, 下載次數(shù): 60)
下載附件
2025-1-4 01:07 上傳
開源設(shè)計,,靈活易用
LabEmbryoCam的硬件和軟件設(shè)計均已開源,,研究人員可以根據(jù)自身需求調(diào)整該表型平臺。該研究的資深作者,、普利茅斯大學(xué)高級研究員,、胚胎表型組創(chuàng)始人Oliver Tills博士解釋說:“我們開發(fā)LabEmbryoCam是為了提供一個便捷的窗口,了解動物如何構(gòu)建自身以及環(huán)境對其產(chǎn)生的影響,。它充分利用了3D打印和人工智能等賦能技術(shù),。LabEmbryoCam使科研人員能夠解決以前無法解決的復(fù)雜研究問題,開源也能使LabEmbryoCam被更多人使用,。”
Plymouth4.jpg (26.39 KB, 下載次數(shù): 19)
下載附件
2025-1-4 01:07 上傳
△ 注解腳部組件以確保運行期間的振動隔離,,集成了用于隔離低頻的3D打印片狀彈簧,以及用于隔離高頻的Sorbothane腳墊,。
3D打印技術(shù)降低成本,,提升創(chuàng)新空間
LabEmbryoCam是一個模塊化系統(tǒng),由消費電子產(chǎn)品,、步進電機驅(qū)動的運動裝置,、單板計算機和FDM 3D打印組件構(gòu)成,并構(gòu)建在鋁擠壓框架內(nèi)。這是一個多功能平臺,,研究人員表示,,它最初的設(shè)計和優(yōu)化目標(biāo)是“對在多孔板格式中培養(yǎng)的發(fā)育中水生生物胚胎進行延時成像”。
團隊在研究報告中寫道:“在可行的情況下,,我們使用3D打印部件以最大限度地降低成本,,并減少對供應(yīng)鏈的依賴。”3D打印的一大優(yōu)勢是能夠定制設(shè)備,,這對實驗室和潔凈室都很有幫助,。用于制造LabEmbryoCam的一些FDM部件包括:安裝在每個角落的3D打印板簧,以減少成像過程中環(huán)境振動的影響,;以及3D打印加濕室,,以應(yīng)對多孔板格式延時成像過程中的蒸發(fā)挑戰(zhàn)。LabEmbryoCam總共使用了100多個3D打印部件,,其STL文件可在Zenodo存儲庫中獲取,。
Plymouth3.jpg (38.76 KB, 下載次數(shù): 26)
下載附件
2025-1-4 01:07 上傳
△ CAD渲染了不同版本的LabEmbryoCam(LEC)的組裝情況。A) V1 LEC使用通用鋁型材和自支撐支架構(gòu)建,,B) V2 LEC采用Rexroth鋁型材,、盲接頭,并包括一個蓋子,。尺寸:寬450毫米,,深390毫米,高475毫米,。
應(yīng)用前景廣闊
Tills博士表示:“LabEmbryoCam使用戶能夠在生命最活躍,、通常也是最敏感的時期應(yīng)用表型組學(xué)。這些儀器已被證明對理解胚胎功能至關(guān)重要,,而且這些反應(yīng)與生命后期相比有顯著差異,。這對于理解全球和海洋變暖對單個物種的影響,以及識別對未來地球可能出現(xiàn)的環(huán)境條件具有適應(yīng)力的物種,、種群和個體至關(guān)重要,。”
LabEmbryoCam背后的團隊建立了一個專門的表型組學(xué)設(shè)施,,以支持胚胎表型組的研究,。除了將該系統(tǒng)開源外,,研究人員還通過Phenomyx CIC(一家社區(qū)利益公司)銷售該系統(tǒng),,該公司致力于支持研究人員將表型組學(xué)方法應(yīng)用于發(fā)育中動物的研究。該儀器已銷往英國和美國的客戶,,其組件在Phenomyx CIC位于普利茅斯科技園的基地進行3D打印和組裝,。此外,普利茅斯大學(xué)的研究人員還將LabEmbryoCam帶到了印度洋進行考察,以支持對圣誕島紅蟹生命早期階段的研究,。
|