求助：3D打印新型冠狀病毒模型

這幾天有熊友向南極熊建議,，3D打印新型冠狀病毒模型,，便于醫(yī)生和科學家更加直觀對其進行研究,。

我們可以從“新型冠狀病毒國家科技資源服務系統(tǒng)”獲取到病毒相關信息,。

中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所成功分離的我國第一株病毒毒種信息及其電鏡照片

毒種信息
毒種編號：CHPC 2020.00001; NPRC 2020.00001
中文名稱：新型冠狀病毒武漢株01
英文名稱：C-Tan-nCov Wuhan strain 01
分類學：2019-nCoV, 冠狀病毒β屬
分離來源：臨床患者
采集地：中國湖北武漢
分離時間：2020年1月6日
生物危害程度：二類
聯(lián)系郵箱：[email protected]; [email protected]
照片來源：國家病原微生物資源庫、(中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所)


新型冠狀病毒核酸檢測引物和探針序列（Specific primers and probes for detection 2019 novel coronavirus）

1.新型冠狀病毒核酸測定（實時熒光RT-PCR方法）
推薦選用針對新型冠狀病毒的開放讀碼框1ab（open reading frame,ORF1ab）,、核殼蛋白（nucleoprotein,，N）基因區(qū)域的引物和探針,。

Target 1（ORF1ab）:
正向引物（F）：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
反向引物（R）：ACGATTGTGCATCAGCTGA
熒光探針（P）：5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'

Target 2（N）:
正向引物（F）：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
反向引物（R）：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
熒光探針（P）：5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
可以核酸提取和實時熒光RT-PCR反應體系參考相關廠家試劑盒說明。

2.結果判斷
陰性:無Ct值或Ct為40,。
陽性：Ct值<37,，可報告為陽性。
可疑：Ct值在37-40之間,，建議重復實驗,，若重做結果Ct值<40，擴增曲線有明顯起峰,，該樣本判斷為陽性,否則為陰性,。

信息來源：“新型冠狀病毒國家科技資源服務系統(tǒng)”官網http://nmdc.cn/#/nCoV

新型冠狀病毒國家科技資源服務系統(tǒng)（以下簡稱系統(tǒng)）由國家微生物科學數據中心和國家病原微生物資源庫聯(lián)合建設，由中國疾病預防控制中心,、中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所,、中國科學院微生物研究所、中國科學院病原微生物與免疫學重點實驗,、中國疾病預防控制中心-中國科學院微生物研究所病原微生物資源與大數據聯(lián)合研究中心等單位共同建設,。系統(tǒng)具備毒種信息、引物信息,、全球冠狀病毒序列信息查詢及分析等功能,。系統(tǒng)獲得國家科技資源共享服務平臺、艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治專項（2018ZX10734404,、2018ZX1010100404）,、中國科學院地球大數據先導A類專項（XDA19050301）、中國科學院戰(zhàn)略生物資源計劃（KFJ-BRP）等項目支持,。

新冠病毒高清晶體結構
2020年1月26日上�,？萍即髮W免疫化學研究所和中國科學院上海藥物研究所抗2019－nCoV冠狀病毒感染聯(lián)合應急攻關團隊宣布：上海科技大學饒子和／楊海濤課題組已測定新型冠狀病毒3CL水解酶（Mpro）高分率晶體結構,，以便有更多的科技工作者,、特別是藥物研發(fā)的科技人員使用。

△2019－nCoV Mpro晶體結構

據介紹,，晶體結構的坐標可到PDB蛋白質結構數據庫（Protein Data Bank,， PDB）下載（PDB ID： 6LU7）。目前蛋白質結構坐標已投遞,，系統(tǒng)正在處理中,。如有急需，可以聯(lián)系上科大免疫化學研究所副研究員楊秀娜：yangxn＠shanghaitech.edu.cn,。

新型冠狀病毒與人ACE2分子復合S蛋白的結構模型
1月21日《中國科學：生命科學》雜志發(fā)表論文《Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission》,，中國科學院上海巴斯德研究所、軍事醫(yī)學研究院國家應急防控藥物工程技術研究中心/中科院分子植物卓越中心合成生物學重點實驗室聯(lián)合發(fā)現分離到的6個武漢新型冠狀病毒（SARI）序列幾乎完全一致，屬于Beta冠狀病毒屬（Betacoronavirus）,，分類上鄰近但不屬于SARS病毒,，二者相似性約為70%；與“中東呼吸綜合征”MERS病毒相似性則只有40%,。
SARS和MERS病毒的單股正鏈RNA基因組由包膜包裹,，都有刺突蛋白（S蛋白），分別通過與血管緊張素轉化酶2（ACE2）蛋白或DPP4蛋白結合,，來感染人的呼吸道上皮細胞,。


△新型冠狀病毒與人ACE2分子復合S蛋白的結構模型


我們3D打印行業(yè)的有關技術人士，能否根據已公布的信息,，對新型冠狀病毒不同維度（3D模型,、晶體結構、基因結構等）進行3D建模呢,？然后3D打印出來,，供給相關工作人員使用？

對于內部交叉復雜結構的呈現,，只要設計好3D模型,，就可以使用透明/半透明/全彩色的3D打印技術進行打印出來。


△科學家們使用專業(yè)軟件建立的冠狀病毒類的模型,，很多冠狀病毒長得比較相似,。真正的2019－nCoV冠狀病毒尚未真正公布。

某醫(yī)學博士告訴南極熊,，“可以打印出來試試,，很多東西都是做出來后，大家一起討論讓它更完善的,。把病毒具體化,，可能對交流和研究，會有不同的思維火花出現,�,！�

請愿意提供幫助/或需要幫助的科學家、醫(yī)生,、3D建模,、3D打印等專業(yè)人士，一起來嘗試做這個事情,。請對此感興趣的專業(yè)人士加入下面微信群（非專業(yè)人士不要加）
如果已經不能掃碼加入,，可先加南極熊客服微信（nanjixiong3），備注留言“3D打印新冠狀病毒”,。