求助：3D打印新型冠狀病毒模型

這幾天有熊友向南極熊建議,，3D打印新型冠狀病毒模型,，便于醫(yī)生和科學(xué)家更加直觀對(duì)其進(jìn)行研究,。

我們可以從“新型冠狀病毒國(guó)家科技資源服務(wù)系統(tǒng)”獲取到病毒相關(guān)信息,。

中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所成功分離的我國(guó)第一株病毒毒種信息及其電鏡照片

毒種信息
毒種編號(hào)：CHPC 2020.00001; NPRC 2020.00001
中文名稱(chēng)：新型冠狀病毒武漢株01
英文名稱(chēng)：C-Tan-nCov Wuhan strain 01
分類(lèi)學(xué)：2019-nCoV, 冠狀病毒β屬
分離來(lái)源：臨床患者
采集地：中國(guó)湖北武漢
分離時(shí)間：2020年1月6日
生物危害程度：二類(lèi)
聯(lián)系郵箱：[email protected]; [email protected]
照片來(lái)源：國(guó)家病原微生物資源庫(kù),、(中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所)


新型冠狀病毒核酸檢測(cè)引物和探針序列（Specific primers and probes for detection 2019 novel coronavirus）

1.新型冠狀病毒核酸測(cè)定（實(shí)時(shí)熒光RT-PCR方法）
推薦選用針對(duì)新型冠狀病毒的開(kāi)放讀碼框1ab（open reading frame,ORF1ab）、核殼蛋白（nucleoprotein,，N）基因區(qū)域的引物和探針,。

Target 1（ORF1ab）:
正向引物（F）：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
反向引物（R）：ACGATTGTGCATCAGCTGA
熒光探針（P）：5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'

Target 2（N）:
正向引物（F）：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
反向引物（R）：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
熒光探針（P）：5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
可以核酸提取和實(shí)時(shí)熒光RT-PCR反應(yīng)體系參考相關(guān)廠家試劑盒說(shuō)明。

2.結(jié)果判斷
陰性:無(wú)Ct值或Ct為40,。
陽(yáng)性：Ct值<37,，可報(bào)告為陽(yáng)性。
可疑：Ct值在37-40之間,，建議重復(fù)實(shí)驗(yàn),，若重做結(jié)果Ct值<40，擴(kuò)增曲線有明顯起峰,，該樣本判斷為陽(yáng)性,否則為陰性,。

信息來(lái)源：“新型冠狀病毒國(guó)家科技資源服務(wù)系統(tǒng)”官網(wǎng)http://nmdc.cn/#/nCoV

新型冠狀病毒國(guó)家科技資源服務(wù)系統(tǒng)（以下簡(jiǎn)稱(chēng)系統(tǒng)）由國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心和國(guó)家病原微生物資源庫(kù)聯(lián)合建設(shè)，由中國(guó)疾病預(yù)防控制中心,、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所,、中國(guó)科學(xué)院微生物研究所、中國(guó)科學(xué)院病原微生物與免疫學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn),、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心-中國(guó)科學(xué)院微生物研究所病原微生物資源與大數(shù)據(jù)聯(lián)合研究中心等單位共同建設(shè),。系統(tǒng)具備毒種信息、引物信息、全球冠狀病毒序列信息查詢(xún)及分析等功能,。系統(tǒng)獲得國(guó)家科技資源共享服務(wù)平臺(tái),、艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治專(zhuān)項(xiàng)（2018ZX10734404、2018ZX1010100404）,、中國(guó)科學(xué)院地球大數(shù)據(jù)先導(dǎo)A類(lèi)專(zhuān)項(xiàng)（XDA19050301）,、中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略生物資源計(jì)劃（KFJ-BRP）等項(xiàng)目支持。

新冠病毒高清晶體結(jié)構(gòu)
2020年1月26日上�,？萍即髮W(xué)免疫化學(xué)研究所和中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所抗2019－nCoV冠狀病毒感染聯(lián)合應(yīng)急攻關(guān)團(tuán)隊(duì)宣布：上�,？萍即髮W(xué)饒子和／楊海濤課題組已測(cè)定新型冠狀病毒3CL水解酶（Mpro）高分率晶體結(jié)構(gòu)，以便有更多的科技工作者,、特別是藥物研發(fā)的科技人員使用,。

△2019－nCoV Mpro晶體結(jié)構(gòu)

據(jù)介紹，晶體結(jié)構(gòu)的坐標(biāo)可到PDB蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（Protein Data Bank,， PDB）下載（PDB ID： 6LU7）,。目前蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)坐標(biāo)已投遞，系統(tǒng)正在處理中,。如有急需,，可以聯(lián)系上科大免疫化學(xué)研究所副研究員楊秀娜：yangxn＠shanghaitech.edu.cn。

新型冠狀病毒與人ACE2分子復(fù)合S蛋白的結(jié)構(gòu)模型
1月21日《中國(guó)科學(xué)：生命科學(xué)》雜志發(fā)表論文《Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission》,，中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所,、軍事醫(yī)學(xué)研究院國(guó)家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心/中科院分子植物卓越中心合成生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室聯(lián)合發(fā)現(xiàn)分離到的6個(gè)武漢新型冠狀病毒（SARI）序列幾乎完全一致，屬于Beta冠狀病毒屬（Betacoronavirus）,，分類(lèi)上鄰近但不屬于SARS病毒,，二者相似性約為70%；與“中東呼吸綜合征”MERS病毒相似性則只有40%,。
SARS和MERS病毒的單股正鏈RNA基因組由包膜包裹,，都有刺突蛋白（S蛋白），分別通過(guò)與血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2（ACE2）蛋白或DPP4蛋白結(jié)合,，來(lái)感染人的呼吸道上皮細(xì)胞,。


△新型冠狀病毒與人ACE2分子復(fù)合S蛋白的結(jié)構(gòu)模型


我們3D打印行業(yè)的有關(guān)技術(shù)人士，能否根據(jù)已公布的信息,，對(duì)新型冠狀病毒不同維度（3D模型,、晶體結(jié)構(gòu)、基因結(jié)構(gòu)等）進(jìn)行3D建模呢,？然后3D打印出來(lái),，供給相關(guān)工作人員使用？

對(duì)于內(nèi)部交叉復(fù)雜結(jié)構(gòu)的呈現(xiàn),，只要設(shè)計(jì)好3D模型,，就可以使用透明/半透明/全彩色的3D打印技術(shù)進(jìn)行打印出來(lái),。


△科學(xué)家們使用專(zhuān)業(yè)軟件建立的冠狀病毒類(lèi)的模型，很多冠狀病毒長(zhǎng)得比較相似,。真正的2019－nCoV冠狀病毒尚未真正公布,。

某醫(yī)學(xué)博士告訴南極熊，“可以打印出來(lái)試試,，很多東西都是做出來(lái)后,，大家一起討論讓它更完善的。把病毒具體化,，可能對(duì)交流和研究,，會(huì)有不同的思維火花出現(xiàn)�,！�

請(qǐng)?jiān)敢馓峁�幫�?或需要幫助的科學(xué)家,、醫(yī)生、3D建模,、3D打印等專(zhuān)業(yè)人士,，一起來(lái)嘗試做這個(gè)事情。請(qǐng)對(duì)此感興趣的專(zhuān)業(yè)人士加入下面微信群（非專(zhuān)業(yè)人士不要加）
如果已經(jīng)不能掃碼加入,，可先加南極熊客服微信（nanjixiong3）,，備注留言“3D打印新冠狀病毒”。